La causa exacta para la aparición de la endometriosis aún no se conoce, por éste motivo no existe hasta hoy en día un tratamiento causal específico a través del cual se pueda eliminar o curar en su totalidad o que evite su aparición.
Existen varias teorías tratando de encontrar la causa, sin que alguna de ellas explique satisfactoriamente todas las formas de presentación de la endometriosis, entre otras tenemos:
La teoría de “SAMPSON” o de la menstruación retrógrada, como el nombre lo dice se basa en que las mujeres durante la menstruación expulsan la sangre y el endometrio a través del canal cervical hacia la vagina, sin embargo se ha observado que el 90% presenta además salida de sangre y endometrio a través de las trompas de Falopio hacia la cavidad abdominal en donde el endometrio que debería ser eliminado por las defensas naturales del organismo se implanta en la superficie del peritoneo, ovarios, vejiga, intestinos, etc. y volverá a tomar vida (es una de las teorías mas aceptadas), la pregunta es ¿Por qué si el 90% de las mujeres tienen menstruación retrógrada, la incidencia anual (nuevos casos) es estimada en un 0.3% y la prevalencia (porcentaje de la población afectada) es de 10-15%?.
La teoría de la “METAPLASIA CELOMICA” postulada por Iwanoff y Meyer se basa en la transformación de las células celómicas en tejido endometrial, ésta teoría podría explicar localizaciones distantes y formas raras de endometriosis.
La teoría inmunológica podría explicar porque algunas mujeres presentan la endometriosis desde el inicio de su menstruación con toda la sintomatología característica (dismenorrea primaria) y otras la presentan hasta después de algunos años (dismenorrea secundaria). Esta teoría se basa en la hipótesis que la mujer en alguna etapa de su vida puede ser mas susceptible a que el endometrio que es expulsado a través de las trompas de Falopio hacia la cavidad abdominal pueda implantarse, volver a vivir y crecer de una forma similar a como lo hace en la cavidad uterina. Se estima que puede ser debido a que la mujer se encuentre en ésos momentos en una etapa de inmunosupresión que evitará que su organismo reaccione en forma normal eliminando ése tejido endometrial, permitiendo con ello su implantación y respondiendo al estímulo hormonal de la misma forma que en la cavidad uterina de acuerdo al estado hormonal proporcionado por los ovarios.
Existen otras teorías como la de diseminación linfática ó vascular, etc., la verdad es que ninguna teoría explica todas las formas de presentación de la enfermedad por lo que no existe un tratamiento específico que la pueda curar o prevenir.
La endometriosis ovárica se estima que se trata de una invaginación de la corteza ovárica (capa superficial) en el estroma (tejido ovárico), iniciando con un implante superficial en la corteza e invadiendo el estroma paulatinamente, otros autores proponen que es la invasión del tejido endometrial que viene del sangrado retrógrado en un cuerpo lúteo (cuerpo amarillo) de la ovulación que sucedió 15 días antes, la razón para pensar en ésta teoría es porque frecuentemente se encuentra en el endometrioma tejido de cuerpo lúteo.
La endometriosis infiltrativa profunda se cree que se trata de una enfermedad diferente con un orígen diferente, los conductos paramesonéfricos de Müller dan origen en la vida embrionaria a los órganos sexuales femeninos, existen evidencias científicas para afirmar que se trata de restos de tejido Mülleriano que en alguna etapa de la vida y por razones que aún se desconocen empiezan a crecer e invadir los órganos o estructuras que se encuentren a su alrededor.
El dilema en la endometriosis radica por un lado en el largo intervalo de tiempo que suele existir entre la presentación de los primeros síntomas y su diagnóstico y por otro lado en las repetidas operaciones a que son sometidas las pacientes que padecen endometriosis sin que con ello exista una mejoría definitiva de los síntomas.
Algunos autores creen que la presentación de la enfermedad sintomática es consecuencia de una suma de factores y orígenes diferentes que por algún motivo coinciden en un momento determinado de la vida de la mujer y permite que la enfermedad se manifieste.
La endometriosis es desde el punto de vista histológico (de patología) una enfermedad benigna, la transformación maligna de la endometriosis es sumamente rara, en la literatura se reporta una frecuencia de hasta 1%.
Debido al característico crecimiento infiltrativo especialmente de una sus formas (endometriosis infiltrativa profunda) la enfermedad puede invadir y afectar órganos vecinos y requerir operaciones muy extensas y difíciles.